Vzdělávacím programem „Studium pro ředitele škol a školských zařízení“ získává jeho absolvent znalosti a dovednosti v oblasti řízení škol a školských zařízení, v oblasti řízení a rozvoje lidských zdrojů, včetně ochrany zdraví, které jsou kvalifikačním předpokladem pro výkon funkce ředitele školy a školského zařízení. Absolvováním tohoto akreditovaného vzdělávacího programu splní ředitel školy podmínku pro výkon funkce, jak ukládá § 5 odst. 2 zákona č. 563/2004 Sb. Vzdělávací program je v souladu se standardy MŠMT, je organizován v 5 modulech v rozsahu 108 vyučovacích hodin přímé výuky a 20 hodin odborné stáže na vytypovaných školách a školských zařízeních. Součástí vzdělávacího programu je doporučené samostudium. Za tímto účelem obdrží každý z účastníků studijní materiály shrnující podrobný obsah jednotlivých modulů, zaměřený na cílové kompetence vedoucích pracovníků.
Vzdělávací program se skládá z 5 modulů: základy práva, pracovní právo, financování školy, organizace školy a pedagogického procesu a dovednosti vedoucího pedagogického pracovníka. Po absolvování výuky ve všech modulech budou účastníci absolvovat pedagogickou praxi formou stáží ve vybraných školách nebo školských zařízeních.